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公元4476年，UN时空研究项目正式启动，公元4497年，UN对外宣布研究人员失踪，4498年，加来大雄成了一个被世人遗忘、被UN、TCPO秘密通缉的名字。
在时空弧中漫无目的地穿行，加来大雄不知道该去往何处。当时的时空战舰只具备原始时空的穿梭能力，还没达到“方舟”那样连接平行宇宙的技术。
时空弧中是人类感官无法理解的高维世界。
巨大的椭圆形战舰之中，可以容纳上千名士兵，但此时，驾驶舱的控制室当中只有加来大雄孤零零的一个“人”。
由于视野被暗合金保护层阻隔，他无法用肉眼观测外面的情况，但是他明白，如果关闭保护层，他会和这艘时空战舰一起葬身在“时空乱流”之中。
“咚，砰咚……”
突然，他的心脏急促地跳动起来，仿佛要窒息一般，大脑在缺氧！
“啊……”
加来大雄脑袋天旋地转，视野扭曲地像一团绿色的鬼火，忽地倒在地上抽搐不止，不断有血沫从鼻孔和耳朵渗出。
加来大雄鼻孔的出血量大得惊人，来自大脑皮层，这又是“蝴蝶效应”，在快要窒息的恐惧感占据大脑之前，他闭上了眼睛！
许久，他停止了抽搐，脸色苍白，手指可以微微弯曲。
“往我脑袋里植入神经控制芯片，想得美。”
加来大雄苦涩的笑着。
“国际联盟的小人们，你们一定没想到吧……”
“亚伯，幸亏你留了这一手。”
加来大雄的潜意识当中，存在着一种奇怪的东西，在他失去意识时，总会出现一个人的身影……
就在刚刚，神经控制芯片的“自毁”程序启动，加来大雄强行以“念力”终止了程序。并且，在被“洗脑”之前，他反其道而行之，巧妙地把记忆备份在神经控制芯片当中，刚刚正是他将记忆导入海马体当中的过程，被动接受记忆是一件很痛苦的事情，就相当于用硫酸铜蚀刻电路板。
“唔……”
加来大雄的身体忽地虚弱起来，嘴里吐出一大口鲜血。
“爱丽丝，没想到你……”
“为什么连你这么善良的人也……”
加来大雄感受到了，身体内的细胞在崩溃中重组，创造中再生！导致这种情况的原因只可能时，“0”号基因被人动了手脚。
加来大雄的“念力”被封印了，原因是植入体内的0号基因序列被病毒感染过，导致他体内细胞核极不稳定，无法进行“0”号基因的表达，即被加置了“基因锁”。
“我一直把你当做我的徒弟，真的想把你培养成我的接班人，为什么……”
加来大雄无助、无望地看着舰体的顶部，那里也有精美的浮雕，天使安琪儿张开了翅膀……
原来充满光明的地方，背后就会有更大的阴影。天堂之下，便是地狱，在天使的影子中，诞生了恶魔。
加来大雄的人生辉煌于UN，也湮灭于UN，就像是兜了一个大圈子，又回到了原地。
若果他死了，“真相”也许永远都不会被人知道吧。当然，他原来所处的那个世界，世界本身恐怕就是最大的“假象”。
冥冥之中，在加来大雄的体内，正在缓慢进行自我修复的细胞，细胞核里的DNA序列传达着一种什么，让加来大雄无法理解的来自“本源”的驱动，让他去寻找什么……
“是什么，是谁，谁在呼唤我！？”
幻觉吗？不！
人体最根本的来源——基因，它从血脉中呼唤着加来大雄，去寻找“本源”。
加来大雄仿佛灵魂被抽离了身体，眼睛当中只剩下了眼白，嘴里却清楚地说道：
四维时空坐标设定（时间：公元前221年，地点：）
“不！”加来大雄突然摆脱了“梦魇”，醒转过来，当他看见中央控制系统正在执行四维坐标设定时，便知道刚刚发生了什么，惊魂甫定，他说道：
“富士山！”
原本，冥冥之中的力量在诱使他前往那个地方，解开基因之中的奥秘。但是，由于他生物的本能挣脱了控制，这样，他又能逃过命运女神的诅咒吗？
公元230年，咸阳城东300里处地动山摇，天降陨星，史载为“天命帝星”，铸剑师欧冶子以陨石为材料，打造“天问”。
极地的冰川、地磁场、重力场，都发生了惊人的改变，没有人能解释其原因，仿佛于6500万年恐龙消失之谜如出一辙，后世砖家众说纷纭。
公元前220年，接连坠下天体陨石，巨大的火球坠落在本州岛富士山巅，顿时爆炸声天崩地裂，火山喷发，熔岩流覆盖了圣岳下广袤的土地。自此，开启了始皇帝东渡大海的寻仙之路。
那一天……
“八嘎，掉到火山口里面去了！”
时空战舰沉入了熔岩流中，到达了火山的岩浆房中，被凝固的熔岩遮盖。
那一天，加来大雄内心不只一千万只“草泥马”奔腾……
命运的钟摆，不由人来控制，他终于还是来了。
次年，公元前219年，东海惊现异术方士，口音殊异，其人自称从“未来而来”，寻“天命之人”，觅“长生灵药”。（日语中有大量汉字）
在帝都咸阳皇宫，两公里的过道，999级台阶，徐福第一次看见始皇帝嬴政手中的天问深邃的陨铁剑体时，便知道，雷斯切利所说的“亚特核心”，所谓“宇宙的坍缩”，或许不是一个骗局。
公元前219年，方士徐福出海寻找“蓬莱仙山”，历时两年，徒劳无功而返，传其遭遇“大鱼”袭击。
其后4年，无史料记载，空白。
公元前215年，始皇帝再次劳民伤财，修建蜃楼，以期觅得“长生灵药”，帝国千秋万代。
公元前214年，帝命徐福率三千童男童女东渡寻仙，终不归，民间传其留于日本。
公元前210年，始皇帝驾崩。
公元前206年，秦三世子婴降汉，秦亡。
史书记：一代阴谋政治家，秦朝“副皇帝”——赵高，死于秦三世子婴之手。
其实不详……
公元前51年，这里是富士山的秋天，生活在山风下的村子，叫做……岚。
这一天傍晚，村子的成员们在族长和长老的召集下，召开了一次重大的会议。
“山鬼一族欺人太甚！”一名受伤的武士气愤地说道。
富士山下，有着大大小小数十个村子，各方集结为势力，彼此争夺稀缺的资源和可供种植的土地。
长年累月的厮杀，鲜血让原本贫瘠的土地更加贫瘠，荒野上，尸骨随处可见。
“妖刀鬼彻，杀神附体。”溃败的武士们各个缠着绷带，握紧手中残破的刀，眼中的惊恐仍未散去。
山鬼一族的人，不知何时变得更加暴戾，尤其是战场上那把让人极度厌恶的妖刀，血红色的刀刃！